Хранителната непоносимост е отговор на храносмилателната система, а не на имунната система.
Произходът му е тясно свързан с храносмилателния процес в тънките черва и с нарушенията на чревната лигавична бариера. По време на храносмилателния процес, преди да влязат в кръвта, протеините в диетата се разграждат на по-малки фрагменти (пептиди), които обикновено се разграждат допълнително до аминокиселини. По време на непоносимост към храна, по-големите пептиди също навлизат в кръвта. Имунната система ги открива и атакува, което при някои индивиди може да причини увеличение производство на IgG антитела. „Псевдоалергията“ е свързана с редица имунни отговори, не всички от които можем да диагностицираме, но които могат да доведат до дълготрайни и хронични здравословни проблеми. Те се използват за диагностика специфични IgG антитела, които според последните изследвания не са единствената причина за симптомите на „псевдоалергия“, но могат да бъдат използвани при нейната диагностика.
Това е ензимно определяне на циркулиращи хранителни антигени - специфични IgG антитела в серума срещу някои храни: