В последната третина от 170-километровия маршрут от Жерармер до Мюлуз водачът на Omega Pharma-Quick Step пое водачеството и без страх пристигна на финала за 4:09:34 ч.
Винченцо Нибали загуби позицията на временен лидер в общото класиране след неделя, който трябваше да се откаже от жълтата фланелка в полза на Тони Галопин. Лото Белисол, който е домакин, стана първият французин, който ръководи класирането от 2011 г., втори след Томас Воклер.
Нибали е начело от седмица след втория етап. В състезанието за точкуване за зелена фланелка първото място без страх принадлежи на словака Петер Саган, най-добрият алпинист е Немец Мартин. Саган зае 109-то място на 9-ия етап, вторият словак на старта Петер Велиц завърши 58-и.
Още при първото изкачване на 2-ра категория в Col de la Schlucht, пелотонът започна да се разпада. На равнината зад първия планински бонус Мартин и Де Марки избягаха и постепенно увеличиха преднината си пред основния пакет. Откриващият хълм, от друга страна, обезсърчи група от спуртисти, водени от Кител, които избраха бавно темпо от самото начало и загубиха пет минути на пелотона при второто изкачване. Мартин, Де Марки, увеличи преднината си начело. Последният обаче се спря на два нежни хълма, които той изкачи преди Мартин и взе пълната печалба за бонуси.
По-малко от 60 км преди финала, елитният триец на време Мартин стартира и постепенно се отърва от колегата си начело на състезанието. Негова плячка е и последващата планинска премия от 1-ва категория на върха на единадесеткилометровото изкачване с над 5 процента надморска височина на Le Markstein, когато той печели 10 точки в оценката на състезанието за най-добър алпинист.
Група преследвачи, водени от Роланд и родния му Галопен, загубиха повече от три минути от Мартин, основният пелотон с Велитс и Саган имаше осем минути и половина закъснение след слизане по хълма. Шансът да облече жълтата фланелка беше напълно използван от Галопин, който се откъсна от останалите ездачи в групата и натрупа преднина от 1:34 минути на секундата на Нибали. На финалната линия Мартин завърши на първо място без страх, като по този начин спечели лаврата на втория етап на турнето.
Етап 9, Жерармер - Мюлуз (170 км):
1. Тони Мартин (Nem./Omega Pharma - Quick-Step) 4:09:34 ч., 2. Fabian Cancellara (CHE/Trek), 3. Greg Van Avermaet (Bel./BMC Racing), 4. Tom Dumoulin ( Hol./Giant), 5. Matteo Montaguti (Tal./AG2R), 6. Jose Joaquin Rojas (Šp./Movistar), 7. Steven Kruijswijk (Hol./Belkin), 8. Mickael Cherel (Fr./AG2R), 9. Brice Feillu (Fr./Bretagne), 10. Tiago Machado (Por./NetApp) всички +2: 45 мин. 58. Питър ВЕЛИЦ (SR/BMC Racing), 109. Питър САГАН (SR/Cannondale)
Непрекъснато класиране след 9-ти етап: 1. Тони Галопин (Фр./Лото) 38:04:38 ч, 2. Винченцо Нибали (Тал./Астана) +1: 34 мин., 3. Мачадо +2: 40, 4. Якоб Фуглсанг (Дания/Астана) ) +3: 18, 5. Ричи Порте (Aus./Eeam Sky) +3: 32, 6. Michal Kwiatkowski (Полша/Omega Pharma - Quick-Step) +4: 00, 7. Alejandro Valverde (Šp./Movistar ) +4: 01, 8. Pierre Rolland (Fr./Europcar) +4: 07, 9. Alberto Contador (Šp./Tinkoff - Saxo) +4: 08, 10. Romain Bardet (Fr./AG2R) + 4: 13