Лаборатория по биомедицинска микробиология и имунология
ХАРАКТЕРИСТИКИ НА РАБОТНОТО МЯСТО
Лабораторията по биомедицинска микробиология и имунология (LBMI) е създадена на 15 март 1996 г. като работно място на две организации - Университета по ветеринарна медицина и фармация в Кошице и Института по невроимунология на Словашката академия на науките, участвали в създаване на сложна изследователска единица в имуногеномиката и имунопротеомиката.
От самото си създаване LBMI осигурява висок стандарт в научните изследвания и образованието. Основната област на изследване на LBMI е да се изследват взаимодействията между гостоприемника и невроинвазивните патогени като Borrelia burgdorferi, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Franciscella, вирусът на Западен Нил и вируса на енцефалит, пренасян от кърлежи, както и да се блокира невроинфламацията в ранен стадий. Основните изследователски дейности са насочени към: а) изучаване на отговора на клетките гостоприемници (образуване на невроваскуларна единица) по време на първоначалната адхезия и проникване на патоген в ЦНС на ниво транскриптом, б) идентифициране на специфични лигандни рецептори и картографиране на домейни, участващи в свързване на патогена с рецепторите на гостоприемника;) подготовка на монодоменни антитела (sdAbs), които могат да преминат директно през кръвно-мозъчната бариера и да разпознават лигандите на патогена, г) развитие на блокиращи антимикробни пептиди. LBMI също така участва в проекта COVID-19 APVV за откриване на местата за свързване на SARS-COV2 и блокиране на адхезията на вируса към клетките гостоприемници с помощта на sdAbs и антивирусни пептиди.
LBMI използва най-иновативните техники, като секвениране на РНК (секвениране от следващо поколение); "Високопроизводителни" протеомични методи, използващи масспектрометрия с т.нар Подходи отдолу нагоре и отгоре надолу; техники за откриване на мутации като SSCP, DGGE, анализи с висока разделителна способност (HRM); директно секвениране на ДНК; количествена PCR в реално време; техники за трансфекция; in vitro производство на рекомбинантни протеини; тестове за протеиново-протеиново взаимодействие; фагов дисплей; афинитетна хроматография; Тестове за изтегляне; култивиране на клетки, образуващи кръвно-мозъчната бариера при хората; и други.
Досега 12 докторанти, които заемат водещи позиции в изследователски институти както в Словакия, така и в чужбина, са преминали обучение в LBMI и са предложили стажове на повече от 30 гостуващи изследователи от различни чужди държави в областта на фаговия дисплей и протеомиката.