Нестандартните резултати от неинвазивен пренатален тест за фетални хромозомни нарушения могат да предоставят допълнителна информация за здравословното състояние на бременните жени

Резюме:

Ключови думи: неинвазивно пренатално тестване, NIPT, свободна фетална ДНК, хромозомни аберации, секвениране на целия геном, окултно злокачествено заболяване, системен лупус еритематозус, SLE

неинвазивен

Въведение

Тестовете NIPT обаче носят предимно геномна информация за бременна жена. Работата на Bianchi et al (7) сочи към откриването на десет неидентифицирани случая на злокачествено заболяване на майката при бременни жени като част от предоставянето на търговски NIPT тест, които също бяха потвърдени по време на последващо клинично лечение. Това е така, защото злокачествените клетки освобождават ДНК в кръвообращението, подобно на плацентата, а туморната тъкан често се състои от клетки с множество хромозомни аберации. Въпреки това, злокачествеността не е единствената възможна причина за улавяне на анормален NIPT хромозомен профил. През 2015 г. Chan et al (8) посочват, че системният лупус еритематозус (SLE) също причинява множество анормални хромозомни артефакти в целия геномен анализ на плацентарната ДНК. Тази работа сочи към заловен случай на бременна жена с множество хромозомни аберации, използващи NIPT тест (9) с анализ на възможни причини. Ние възприемаме способността да улавяме и други отклонения в допълнение към тестваните като основно предимство на целия геномен подход при NIPT скрининг.

материали и методи

INрезултати

В първия NIPT анализ на пробата получихме 6,9 милиона сдвоени четения, които бяха уникално картографирани в генома на GRCh37. Установена е положителност за тризомия на хромозома 18 (Z резултат> 6) и в същото време Z стойностите на хромозоми 21 и 13 са в сивата лента (Z резултат между 2.5 и 4), което е нестандартно (снимка 1). Резултатът след второто вземане на проби беше същият. Използвайки инструмента Circos, оценихме разпределението на четенето във всички автозоми (снимка 2). Наблюдавахме наличието на множество субхромозомни аберации (микроделеции и дублирания) на всяка от хромозомите (снимка 1). Въз основа на резултатите, пациентът е показан за амниоцентеза.

Дискусия и заключение

Неинвазивните пренатални тестове на практика показват висока чувствителност и специфичност при откриване на най-често срещаните фетални анеуплоидни анализи на свободна фетална ДНК в периферната кръв на бременни жени. От първоначалното мнение на експерти по пренатална грижа, използваща NIPT теста като алтернатива на стандартния скрининг за бременни жени с по-висок риск от плод със синдром на Даун, да се види промяна към целесъобразността на използването на теста като първата опция за скрининг за най-много чести фетални анеуплоидии. Въпреки това, група тестове, базирани на сканиране на целия геном, могат да предоставят допълнителна информация, която засяга самата бременна жена.

Когато предоставяхме NIPT тест в нашата лаборатория, ние заснехме случай на бременна жена, която имаше необичаен резултат от NIPT теста, и при визуализиране на разпределението на показанията за всички хромозоми, ние наблюдавахме голям брой субхромозомни аберации (дублиране и заличаване). Окултната злокачественост е едно от възможните обяснения за получаване на този нестандартен резултат.

Масата на злокачествения тумор може да има всички или субпопулации от клетки със субхромозомни аберации, които оцеляват и се размножават поради нарушение в механизмите за контрол и възстановяване на клетката. По време на разпадането на такива клетки анормалната туморна ДНК се освобождава в циркулацията и по този начин променя относителния дял на фрагментите в анормалните области. Няколко проучвания съобщават за откриване на такива случаи на латентно злокачествено заболяване на ранен етап в рамките на NIPT, които впоследствие са потвърдени, локализирани и евентуално лекувани при по-нататъшно клинично лечение (7).

Причината за идентифицирания отклонен профил обаче може да бъде и СЛЕ и въпреки все още недостъпната информация от литературата, може да се предположи, че други автоимунни заболявания могат да причинят подобен резултат. Когато се наблюдава анормален профил, трябва да се изключат СЛЕ или други автоимунни заболявания при пациента. Пациентът обаче не е съобщавал за СЛЕ в медицинската история.

В анализирания случай трябва да се вземе предвид и трета алтернативна причина. Бременната жена е била подложена на процедура за ин витро оплождане, докато са имплантирани два ембриона, единият от които не процъфтява. По този начин, един от ембрионите може да бъде източникът на аберантна ДНК, наблюдавана при NIPT теста.

Необходими са допълнителни изследвания и допълнителни анамнестични данни, за да се определи окончателно причината за наблюдавания анормален профил. Ключът е резултатът от анализа на пробата, получена от амниоцентеза, благодарение на която ще бъде възможно да се изключат отклоненията, налични в процъфтяващия плод. Поради събирането от вътрешността на амниотичната торбичка на феталния близнак, може да не е възможно да се определи дали отклонената ДНК, уловена в периферната кръв, произхожда от втория ембрион. Пациентът обаче отказва. Проба от плацента, получена чрез CVS и нейния анализ на кариотипа, може да бъде подходящ метод за определяне на ембрионалния произход на анормална ДНК. Определено обаче ембрионалният произход на ембрионалната ДНК може да бъде потвърден или отхвърлен само след края на бременността според изчезването на аберантния сигнал. Ще бъде възможно да се провери хипотезата за наличие на СЛЕ от медицинската история на пациента или чрез специфични изследвания. Като се изключат предишните причини, трябва да се разследва окултно злокачествено заболяване.

Заключение

Целият геномен подход за неинвазивно тестване за най-често срещаните хромозомни нарушения може да бъде важен източник на информация за здравословното състояние на бременните жени и по този начин да помогне за откриването на сериозни патологични явления. Идентифицирахме случай с множество хромозомни аберации с няколко възможни причини, но е необходим подходящ алгоритъм за диференциална диагностика, за да се определи тяхната причина.