Въпреки че многократно бяхме успешни в международното състезание, не пропуснахме средствата от еврофондовете, казва биохимикът Йозеф Носек в интервю.

Словашки учени публикуваха в престижното списание Scientific Reports. Използвайки елегантна експериментална стратегия, те разкриха ролята на транспортните протеини в клетъчните мембрани. Проектът беше ръководен от Йозеф Носек и ръководен от авторския екип на Андреа Чилингева, и двамата от Факултета по природни науки на Карловия университет в Братислава. В интервюто те обясняват същността на своите открития и също така оценяват финансирането на науката в Словакия.

Какви са вашите изследвания?

Йозеф Носек (JN): Ние се интересуваме от биологията на дрождите. В един от нашите проекти ние изследваме как различните хидрокси производни на бензола и бензоената киселина влияят върху техните клетки. Тези прости ароматни вещества са много важни за химическата промишленост. Самият бензен е токсичен и има канцерогенни ефекти. От друга страна, бензоената киселина обикновено се използва като консервант в хранителната промишленост, тъй като предотвратява растежа на много микроорганизми, като гъбички. Някои от неговите производни са намерили приложение в медицината (аспирин) и козметиката (парабени).

Най-големият естествен източник на ароматни вещества е лигнинът, който е един от най-често срещаните органични полимери в биосферата. Замърсяването на околната среда от ароматни съединения обаче е до голяма степен причинено от промишлеността. Бензенното ядро ​​на ароматни молекули е химически относително стабилно. Някои микроорганизми обаче могат да го разграждат от ензими и да го използват като източник на въглерод и енергия за растежа им в последващи биохимични реакции. Такива микроорганизми включват и някои видове дрожди, с които се справяме в нашата лаборатория. Не се знаеше обаче как са го направили.

Йозеф Носек (1967)

учи генетика и молекулярна биология в университета Коменски в Братислава. Завършил е няколко изследователски престоя във френските университети. Днес той е професор по биохимия в Природонаучния факултет на Карловия университет. От 2001 до 2011 г. работи като международен изследовател в Медицинския институт на Хауърд Хюз в САЩ. Заедно с Любомир Томашек той основава лабораторията на катедрите по биохимия и генетика, в която те изучават биологията на дрождите.

Какво открихте?

JN: Открихме гените, необходими за метаболизма на ароматните съединения в дрождите. Също така изследвахме връзката на съответните биохимични реакции с централния метаболизъм на еукариотните клетки (всички многоклетъчни организми в най-широк смисъл са изградени от еукариотни клетки. Те са по-сложно структурирани и обикновено по-големи от прокариотните клетки) и как клетката контролира функциите на отделни гени. Чудим се как пътищата на тези биохимични реакции са възникнали в еволюцията.

благодарение
Колонии от патогенни дрожди Candida parapsilosis, растящи в чашка на Петри върху хидроксибензоатна среда. Снимка - архив Nosek и Cillingová

В последната ни работа в Scientific Reports открихме протеини, които транспортират хидрокси производни на бензоената киселина през плазмената мембрана в клетката, където те се използват по-нататък. Въпреки че такива протеини са известни от бактериите, те отдавна не са открити в еукариотните клетки. Разработихме стратегия за намиране на два от стотиците транспортни протеини в клетките, които носят хидроксибензоати. Резултатите от нашите изследвания донесоха нови биологични знания, но също така показват, че дрождите могат да се използват за отстраняване на токсичните ароматни вещества от околната среда.

Въпреки че повечето съавтори на статията са словаци, вие ръководите международен екип. Как беше координирано такова сътрудничество за вас?

JN: Нашите изследвания изискват сътрудничеството на експерти не само от различни области на науката (биохимия, генетика, геномика, микробиология и информатика), но и от различни европейски страни. Заедно с Игор Земан, Мартина Небохачова, Любомир Томашек, нашите докторанти и студенти от Факултета по природни науки, Карловия университет, експерти от Унгария, Полша и Испания също взеха участие в изследването.

Понастоящем международното сътрудничество е ключово за научните изследвания. Той дава възможност не само за обмен на идеи и опит, но и споделяне на научноизследователска инфраструктура и ефективно използване на средства, които са много ограничени, особено у нас. Познаваме се с колеги от чужбина отдавна и си сътрудничим и по други проекти, така че координацията на работата не беше проблематична. Много се радвам, че няколко докторанти и студенти от нашия факултет допринесоха значително за постигнатите резултати. Освен научни резултати, нашият проект допринесе и за образованието на млади учени и показа, че въпреки проблемите, които имаме в Словакия, добра наука може да се направи и у нас.

Отгоре: Подреждане на аминокиселинната последователност на хидроксибензоатния транспортен протеин в цитоплазматичната мембрана на клетката. Вляво: Колонии от дрожди, растящи в чашка на Петри върху хидроксибензоатна среда. Вдясно: В дрождената клетка на фигурата хидроксибензоатният транспортен протеин е свързан с флуоресцентен протеин, който свети в зелено (GFP) и клетката е наблюдавана под флуоресцентен микроскоп. Експериментът показва, че изследваният транспортер се намира в цитоплазмената мембрана. Снимка - архив Nosek и Cillingová

Първият автор на статията е Андреа Чилингова, докторант от Катедрата по биохимия. Защо решихте да следвате в Природонаучния факултет на Карловия университет и не отидохте в чужбина?

Andrea Cillingová (AC): Основната причина да не отида в чужбина беше, че не исках да напусна семейството и приятелите си, които имам в Словакия. Реших да уча биология и Факултетът по природни науки, Карловият университет беше най-добрият избор. След като завърших магистратурата си в катедрата по генетика, реших да се посветя на научна работа, затова продължих докторантурата си, този път в катедрата по биохимия, но все още в същата лаборатория, която покрива и двете работни места. Научната работа в двата отдела е доказателство, че дори в Словакия е възможно да се произведе качествена научна работа, която да е напълно конкурентна в сравнение с чуждестранните. Със сигурност не съжалявам за решението си да остана в Словакия.

Андреа Чилинг (1988)

е докторант в университета Коменски в Братислава. Работи в съвместната лаборатория на Катедрите по биохимия и генетика на Природонаучния факултет на Карловия университет. В дисертацията си той изследва метаболизма на хидроксиароматичните вещества в дрождите.

Кандидатствали сте за чуждестранна субсидия или субсидия, финансирана от еврофондове?

JN: Повече от десет години ние финансирахме нашата лаборатория главно от две безвъзмездни средства от Медицинския институт на Хауърд Хюз, една от най-престижните биомедицински институции в САЩ.

Що се отнася до еврофондовете, аз бях част от екип от изследователи от SAS и два университета в Братислава, които подготвиха проекта. Следователно мога да сравня и двата опита. В случая на безвъзмездни средства от САЩ проектите включват информация за ръководителя на екипа, резултатите до момента и предложение за план за изследване, а критериите за оценка бяха ясни и точни. За еврофондовете научното намерение беше само незначителна част от заявлението и по-голямата част от „проекта“ трябваше да съдържа подробна спецификация на оборудването, което планирахме да закупим в лабораториите.

Въпреки че многократно бяхме успешни в международното състезание, не пропуснахме средствата от еврофондовете поради липсата на средства, разпределени в поканата. С глупава администрация обаче излишно загубихме много ценно време, което бихме могли да отделим за проучване или обучение на нашите ученици.

През последните години многократно критикувахте образователната система и финансирането на науката в Словакия. Как гледате на този проблем в момента? Какво бихте предложили да промените?

JN: По принцип всичко, което критикувахме в миналото с моя колега Ľubomír Tomášek в списанията .týždeň (тук, тук и тук) и The Scientist не се е променило и все още си заслужава критика. Дори чувствам, че ситуацията в момента е още по-лоша, отколкото писахме по онова време.

Настоящият случай с разпределението на еврофондовете за наука е парадоксален, още повече че фактът, че тези, които са го изградили и използват от години, вече протестират срещу тази система за разпределение на средствата. През последните седмици се писа много за тях и прокурорите трябва да участват по-интензивно в обвинението, отколкото самите учени. Въпреки това няма да простя едно сравнение. Бюджетът на Министерството на образованието за тази година отпусна 780 000 евро за всички топ екипи в нашите университети. За разлика от тях министерството планира да разпредели почти 600 милиона евро на странни компании за „стратегически изследвания“.

Системата за финансиране на науката и научните изследвания у нас е изкривена, не можем да разграничим качеството от средното

По-разумен начин за разделяне на еврофондовете в наука беше предложен наскоро от професор Ян Пишут (министър на образованието през 90-те години, бел. Ред.). Състои се в минимизиране на влиянието на длъжностни лица, контролирани от политици, и в започване на разпределяне на пари само според качеството на изследователските групи. Това биха били например такива групи, които вече са преминали оценката на Комисията по акредитация или са били идентифицирани в Словашката академия на науките. Друго решение може да бъде увеличаването на бюджетите на грантовите агенции VEGA (научна агенция за безвъзмездна помощ на Министерството на образованието и Словашката академия на науките, бел. Ред.) И APVV (Агенция за подкрепа на научните изследвания и развитието), които играят ключова роля в финансиране на научни проекти и европейски пари.може да започне финансиране на научни изследвания на европейско ниво.